鼠疫（plague）是由鼠疫耶爾森氏菌（Yersinia peslis） 所引起的烈性傳染病，致死率極高，屬於一種自然疫源性疾病 ，也是一種與動物生態循環有關的野生動物病，其形成是長期生物演化的結果，而在地方的肂虐一般稱「人間鼠疫」。

　　這個讓人聞之色變的古老疾病，在歷史上被冠上「黑死病」之名，在西元6世紀、14世紀、19世紀曾造成世界性鼠疫大流行，除人命傷亡慘重之外，更對被波及地區的國家社會產生重大影響與變遷。 人類對這個疾病的理解和控制，目前基本上被認為和現代醫學與醫療進展，以及國家力量對社會的有效支配與管理相關連。近期以來學科整合和新技術引進，如生態環境、醫學地理、空間流行病學及地理資訊系統（GIS）等，均為這一古老而威脅重大的疫病，注入了更多理解面向，也在跨學科多維視野下開發新議題，並重啟了部分歷史研究課題，而對於「人間鼠疫」流行所造成的社會經濟問題，也有了更多討論，例如有關「明清易代」的見解 。引發人間鼠疫流行的鼠疫菌、宿主和媒介各有特定分布區域，並存在着各自的社會空間屬性。

　　由於自然環境的變化不受人為國界限制，因此若將長期而跨區域流行的鼠疫，放到環境史和全球史的視野中，相信能更好瞭解這一傳染病所造成的影響。 在此前提下，本書聚焦於東南海域下的金門，試圖理解這個位處九龍江口，自大航海時代以來編織入世界史脈絡中的蕞爾小島，在邊界與樞紐的雙重地理位置上，百姓如何面對黑死病的肆虐，以及惡疫橫行時，國家與地方社會的位置。

　　疫病本身及其傳播途徑牽連起人間鼠疫的流行，因此生態環境、區域地理、自然災害、移民、交通、人口流動，將是觀照這個議題的指標和背景。 當前對鼠疫的鑑定來自細菌學及血清學的認定，而這是近代以來醫學進展的重要成果，因此鼠疫目前已是醫學學科認定下的一項疾病；而在歷史上對於這項疾病，除文獻欠缺之外，更大的問題是過去大多以「瘟疫」、「時疫」、「大疫」等詞彙，涵蓋了大多數的烈性傳染病，因此目前有關歷史上鼠疫的研究，主要是臨床上以淋巴及血管系統的炎症和組織出血為基本特徵，並依據發病部位的病理變化，通常分成腺鼠疫（bubonic plague）、肺鼠疫（pneumonic plague）和敗血型鼠疫（septicaemic plague）等三大類型 ，而在過往的大規模流行上，最主要是由腺鼠疫所造成的危害，部分地區腺鼠疫和肺鼠疫並行。

　　依據《金門鼠疫防治檔案》的資料紀載，金門最主要是腺鼠疫肆虐，少數仍有肺鼠疫流行的記錄。 在資料方面，金門自光緒20年（1894）方才出現明確的疫症之名 ，但一直要到戰地政務時期（1956～1992） ，鼠疫作為一種現代醫學界定下的傳染疾病，方被清楚認知，並被有效管控及留下相對可靠紀錄。在此之前，金門鼠疫的流行，夾雜在「時疫」一詞中，記錄在方志的祥異或五行志、口傳、地方文獻和驅疫的民間信仰習俗上，因此方志、民間刊行的珠山僑刊《顯影》 、族譜、《正氣中華報》 、官方檔案及田野資料，這些是目前理解金門鼠疫疫病及防治的主要資料依據。特別是《顯影》中和鼠疫相關的記載，更是國史館《金門鼠疫防治檔》資料公布前，最真實報導記錄的民間史料，這些來自當時民間人士的所思、所見、所感和所聞，而「幸存」的史料 ，留下了當時金門百姓面對鼠疫時的衝擊和心靈景況，強化且生命化了冰冷檔案的記錄和敘述，後代人在閱讀文獻時，能經由敘事，有著設身處地，生命交會後所產生的溫度與感動。

　　1894年金門鼠疫的流行，被視為是19世紀以來歷經百年（1855-1959）世界性鼠疫大流行的一環，從1946年《金門鼠疫防治檔》的檔案事由「奉令轉知英國駐東南亞特派員公署疫情情報科宣部溫州為鼠疫區」（詳本書陸、〈金門鼠疫防治檔案〉（一）（1946～1951））也可看出防疫無國界的區域性。根據《金門縣志》的記載，1894年在後浦頭（浦頭）、後水頭（汶水）、沙尾（沙美）等地，造成數百人的傷亡， 1908年鼠疫流行，當時約有8千人喪命，占全島五分之一人口， 這對於一個孤立且維生條件不佳的島嶼，所帶來的社會衝擊，自然是相當嚴重。襲捲金門的鼠疫，除可納入這波世界性鼠疫大流行之外，自1894年直到再無病情傳出的1953年，將近一甲子的歲月，卻歷經滿清、日本和中華民國政府三個不同的政權統治，並對於這一「烈性傳染病」分別有著不同的對應，因此選擇金門作為研究焦點與田野場地，也可觀測傳統和現代性的議題，特別是被國家力量相對徹底整編的金門地方社會。