細菌實驗室及特設監獄系侵華日軍第七三一部隊進行細菌研製和活人實驗的犯罪核心部門，本書即是反映該遺址發掘與研究的考古專題報告。

報告主要分上下兩編：上編以豐富的第一手發掘資料，詳細地介紹了細菌實驗室、特設監獄、中心走廊及庭院等各種遺跡現象和出土遺物，尤以爆炸穴點和掩埋灰坑的發現備受關注；下編通過科學測定、類比實驗的資料分析，對當時的建築技法和施工工藝進行了深入探討，並參考歷史圖片資料製作了部分復原圖像。另在結語中，對本次發掘的主要成果進行了歸納和論述。