海洋是地球生物資源的巨大寶庫，其中海洋微生物的種類可多達上億種。隨著現代生命科學與生物技術的進步，海洋微生物已成為先導化合物和海洋創新藥物研究與開發的豐富資源。 《中華海洋本草:海洋藥源微生物》分上、下兩篇，共11章。上篇為海洋微生物基礎，主要介紹海洋微生物的基礎知識，包括海洋微生物的形態與結構、海洋微生物的生理與代謝、海洋微生物的遺傳與進化、海洋微生物的生態與分布、海洋微生物的利用與開發、海洋微生物研究方法與技術等。下篇為海洋藥源微生物及其活性物質，按海洋古菌、海洋細菌（真細菌、黏細菌、放線菌）、海洋原核藻類、海洋真菌（真菌、酵母菌）、海洋特殊環境微生物（深海高壓、熱液口、共附生、濕地、極地）等介紹海洋藥源微生物和活性代謝產物及其功效等，共收錄海洋藥源微生物312種（株）。

上篇 海洋微生物基石出 1 海洋微生物的形態與結構 1.1 概述 1.1.1 微生物的概念和類群 1.1.2 人類對微生物世界的認識史 1.1.3 海洋微生物研究的興起與發展 1.1.4 微生物學的發展促進了人類進步 1.1.5 微生物的共同特性 1.1.6 微生物的分類與命名 1.2 病毒 1.2.1 病毒的特點 1.2.2 病毒的結構和化學組成 1.3 原核微生物 1.3.1 細菌 1.3.2 古菌 1.3.3 放線菌 1.3.4 藍細菌 1.4 真核微生物 1.4.1 真菌 1.4.2 藻類 1.4.3 原生動物 2 海洋微生物的生理與代謝 2.1 海洋微生物的營養類型 2.1.1 光能自養菌 2.1.2 化能自養菌 2.1.3 化能異養菌 2.2 海洋微生物的營養需求 2.2.1 對碳源的需求 2.2.2 對氮源、氨基酸的需求 2.2.3 對水的需求 2.2.4 對無機鹽的需求 2.2.5 對生長因子的需求 2.3 海洋微生物對生長條件的需求 2.3.1 對溫度的需求 2.3.2 對光的需求 2.3.3 對pH的需求 2.3.4 對氧氣的需求 2.4 海洋微生物對多糖的水解 2.4.1 幾丁質的水解 2.4.2 褐藻膠的水解 2.4.3 瓊膠的水解 2.4.4 卡拉膠的水解 2.5 海洋微生物蛋白黴對蛋白質的水解 2.5.1 微生物蛋白黴 2.5.2 微生物蛋白黴來源 2.5.3 生物活性　 2.6 海洋微生物藥物的生物合成 2.6.1 非核糖體　鍵合成黴途徑 2.6.2 聚酮合成黴途徑 2.6.3 組合生物合成 3 海洋微生物的遺傳與進化 3.1 細菌基因組學與遺傳學 3.1.1 細菌基因組的一般結構特征 3.1.2 質粒、噬菌體與轉座子 3.1.3 細菌基因組的功能特征 3.1.4 細菌基因組的復制 3.1.5 細菌基因組的轉錄 3.2 藍藻基因組學與遺傳學 3.2.1 概述 3.2.2 藍藻基因組 3.2.3 藍藻分子系統學 3.2.4 藍藻突變體研究 3.2.5 藍藻基因表達系統 3.3 古菌基因組學與遺傳學 3.3.1 古菌的基因組及其基本復制機制 3.3.2 古菌基本轉錄機制及基因表達調控 3.3.3 古菌蛋白翻譯系統 3.3.4 古茵遺傳操作技術 3.4 真菌基因組學與遺傳學 3.4.1 概述 3.4.2 幾種真菌基因組 3.4.3 真菌比較基因組學 3.4.4 真菌功能基因組學 3.4.5 真菌基因組數據相關網站 3.5 病毒基因組學與遺傳學 3.5.1 概述 3.5.2 病毒基因組的類型 3.5.3 病毒基因組的復制 3.5.4 病毒基因組的表達和調控 3.5.5 病毒基因組表達的轉錄調控 3.5.6 病毒基因組表達的轉錄後調控 4 海洋微生物的生態與分布 4.1 海洋微生物在海洋環境中的分布 4.1.1 海水中細菌的水平分布 4.1.2 在海水中的垂直分布 4.1.3 在海洋底泥中的分布 4.1.4 影響海洋微生物分布的因素 4.1.5 海洋微生物的特征 4.2 海洋生物之間的相互作用 4.2.1 海洋微生物之間的相互關系 4.2.2 海洋微生物之間的遺傳物質交換 4.2.3 海洋微生物與海洋藻類之間的相互關系 4.2.4 海洋微生物與海洋動物之間的相互關系 4.2.5 海洋微生物與海洋植物之間的相互關系 4.3 微生物在海洋生物地球化學循環中的作用 4.3.1 微生物在海洋碳循環中的作用 下篇 海洋藥源微生物及其活性物質 海洋微生物名詞索引 海洋微生物拉丁名索引 海洋藥源微生物代謝產物索引