「傳染病工作手冊」於1992年5月首次出版後，歷經2001、2004年修訂，並於2006年改以多媒體光碟形式出版，使其攜帶方便於查閱。本手冊提供常見傳染病之疾病概述、致病原、流行病學、傳染途徑、病例定義及防疫措施等，作為衛生機關防治傳染病之參考依據。