全書分「丸散膏丹」十門、「杜煎膠露油酒」四門，共十四類。十門依次為補益心腎門、脾胃泄瀉門、飲食氣滯門、痰火咳嗽門、諸風傷寒門、諸火暑濕門、婦科門、兒科門、眼科門、外科門等。每門分列丸散膏丹若干種，每種藥劑名下論述了該藥的適應證和服用方法。全集「補益心腎門」收載有丸散膏丹85種；「脾胃泄瀉門」收載有丸散膏丹31種；「飲食氣滯門」收載有等丸散膏丹32種；痰火咳嗽門收載有丸散膏丹18種；諸風傷寒門收載有丸散膏丹32種；諸火暑濕門收載有丸散膏丹45種；婦科門收載有丸散膏丹35種；兒科門收載有丸散膏丹25種；眼科門收載有丸散膏丹23種；外科門收載有丸散膏丹43種；杜煎膠13種；膏17種；花露21種；油酒12種；續增丸散膏丹40種。