一路走來,始終如一:義大利中世紀B 肝病毒和現在幾乎零差異 ... | b型肝炎遺傳

這種傳染病由B 型肝炎病毒(Hepatitis B virus)引發Read More. ... 隨著古代DNA 次世代定序技術的進展,古代遺傳學成為探索傳染病的新工具。

繁體简体NavigateYouareat:Home»專題報導»基因與考古»一路走來,始終如一:義大利中世紀B肝病毒和現在幾乎零差異對台灣人而言,B型肝炎不是陌生的疾病。

這種傳染病由B型肝炎病毒(HepatitisBvirus)引發,在台灣一度非常普遍,導致嚴重的全民健康問題,所幸靠著對新生兒施打疫苗及防制傳播的防疫策略,如今台灣30歲以下的民眾,B肝病毒帶原比例已降到很低。

不過,在較年長的族群中,仍有相當比例的帶原者。

古人遺骸追尋B肝病毒蹤影B肝病毒肆虐的地區不只台灣,而是世界各地;年代也不只現代,可以確定有至少幾百年前的古人感染過此一傳染病。

2012年發表的論文指出,研究團隊由來自韓國的楊州市,一具16世紀的木乃伊中,復原B肝病毒3215個核苷酸長的完整基因組,證實B肝病毒已存在於當時的韓國。

[1]隨著古代DNA次世代定序技術的進展,古代遺傳學成為探索傳染病的新工具。

由古人遺骸中,獲取細菌、病毒、瘧原蟲等致病性微生物的遺傳物質,不但能一窺古人的健康狀況,還能研究病原經歷的演化史,幫助我們更了解疾病的來龍去脈。

今年發表的論文,報告了第二個B肝病毒的古代基因組,其樣本來自義大利的拿波里,一具16世紀的兒童木乃伊。

然而這項計劃本來的目標,其實是天花。

[2]無心插柳柳成蔭:尋找天花意外發現B肝病毒這具距今450年左右的木乃伊中,研究團隊本來預期會見到天花病毒,因為之前對木乃伊進行生物考古學分析時,在電子顯微鏡下的病理特徵看起來非常類似天花感染[3]。

同一研究團隊不久前也曾從一具17世紀的立陶宛木乃伊中,取得完整的天花基因組[4]。

出乎意料的是,這回來自義大利的樣本,定序後竟然找不到任何天花病毒,反倒偵測到大量B肝病毒的DNA序列。

B肝病毒在現代並不罕見,而木乃伊中屬於B肝病毒的遺傳物質,會不會是因為取樣時受外界汙染呢?由幾點線索看來,機率很低。

本研究從木乃伊各部位取樣共超過10處,每個樣本獨立定序,大部分偵測到B肝病毒,卻沒有天花病毒的DNA片段;另外,該木乃伊同一遺址的其他遺骸,皆沒有定序到B肝病毒。

另一方面,古代DNA由於年久失修,在片段末端常見特定的損傷特徵,可作為DNA是否源自古代,而非現代汙染的判斷指標。

木乃伊樣本的定序結果顯示,不論來自B肝病毒,或人類的粒線體DNA片段,兩者皆呈現類似的損傷特徵。

由以上幾點判斷,木乃伊中發現的B肝病毒DNA,確實來自16世紀。

由這些片段能拼湊出B肝病毒平均覆蓋率(coverage)高達163.8的基因組。

電子顯微鏡下的B肝病毒。

來源:Wiki。

各地B肝病毒的分家年代遠早於16世紀根據遺傳差異,B肝病毒目前可分為10種基因型,被稱為A到J型,各自有流行的地理區分佈,例如A型最常出現在西北歐與美國,亞洲常見B和C型,地中海一帶、中東、印度則流行D型。

本次獲得的B肝病毒基因型屬於D型,考量到它來自地中海地區的義大利,表示D型病毒至少數百年前起已存在於該處直至今日。

類似狀況也見於之前發表的韓國古代B肝病毒,它被歸類於C型,和今日流行於當地的基因型一致。

B肝病毒是一種DNA病毒,一般印象中,病毒的基因突變率、演化速度似乎很快。

令人驚訝的是,此次取得的義大利古代B肝病毒,儘管距今已有450年左右,遺傳上竟然和現代的同類沒什麼差異(前文已解釋過,該樣本遭到現代病毒汙染的可能性不大)。

另一方面,已知的韓國與義大利兩個案例都顯示,該地區數百年前古人感染的B肝病毒,基因型和同一地點的現代人一樣。

由此只能推論,如今B肝病毒的10種基因型,分家年代應該遠遠早於16世紀;然而光靠已知樣本,並不足以釐清更詳細的演化史。

還有一個有趣的問題:為什麼之前木乃伊被病理診斷為天花?論文推測,小孩感染B肝病毒後,有時會導致小兒丘疹性肢端皮膚炎(Gianotti-Crostisyndrome),使皮膚形成類似天花感染的外觀而造成混淆,誤判疾病種類。

而透過論文研究指出古代DNA分析,正好是調查遺骸身前罹患疾病時,避免因形貌導致誤判的絕佳利器!文  / 寒波延伸閱讀:古天花病毒掀起歷史疑雲參考文獻:1.Kahi


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