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1. 大腸直腸癌「個人化醫療」的進展
二、微小衛星體不穩定性(microsatellite instability，MSI)與5FU輔助性化療核酸誤配修復(mismatch repair，MMR)酵素MLH1、MSH2、PMS2、MSH3/6負責DNA之 ... 專題討論7：惡性病個人化醫療之展望PerspectivesonPersonalizedCancerTherapy程 序 表S7-3大腸直腸癌「個人化醫療」的進展ProgressofPersonalizedTherapyinColorectalCancer葉坤輝台灣大學醫學院腫瘤醫學研究所台大醫院腫瘤醫學部 大腸直腸癌在台灣的發生率逐年上升，已是國人癌症發生率的第一位。
化學治療藥物(5-Fluorouracil，簡稱5-FU、irinotecan、oxaliplatin等)?用新一代的標靶治療藥劑(cetuximab、bevacizumab等)已可有效延長晚期轉移性腸癌病人的中位數存活期。
隨著「個人化醫療」的進展，腸癌已有若干重要的「預後性」(prognostic)與「預測性」(predictive)生物標記(biomarker)可資運用，茲分述如下：一、Thymidylatesynthase(TS)，Excisionrepaircross-complementing1(ERCC1)，UGP-glucuronosyltransferase1A1(UGT1A1)與化學治療TS為5FU抑制嘧啶合成路徑之「標的酵素」，已知TS的表現降低與5FU治療反應率升高有顯著相關。
ERCC1是鉑類化合物(platinums)作用於細胞DNA的修復機制，細胞ERCC1的表現升高與oxalipatin為主的化療反應率降低有關。
TS與ERCC1均屬治療「反應」的predictive標記。
UGT1A1則是irinotecan的代謝酵素，UGT1A1＊28promoter的基因多形性(TA)7TAA同合子homozygousalleles引起UGT1A1活性降低，而使irinotecan的治療毒性大幅增加，屬於治療「毒性」的predictive標記。
二、微小衛星體不穩定性(microsatelliteinstability，MSI)與5FU輔助性化療核酸誤配修復(mismatchrepair，MMR)酵素MLH1、MSH2、PMS2、MSH3/6負責DNA之誤配修復，MMR酵素喪失(defectiveMMR，dMMR)時引起MSI不穩定性升高(MSI-high，MSI-H)，分別佔第二期與第三期腸癌之22%與12%。
這些MSI-H的腸癌病人預後較佳(prognostic)，但是接受5FU輔助性化療不但無益反而有害(predictive)，dMMR/MSI-H可作為prognostic與predictive標記。
三、KRAS、BRAF與EGFR單株抗體KRAS(codon12與13)突變型，造成KRAS下游訊息傳遞持續活化，是EGFR單株抗體(cetuximab、panitumumab)治療緩解率較低，無惡化存活期(PFS)較短的重要predictive標記，至於是否為prognostic標記仍莫衷一是。
BRAF(V600E)突變型是腸癌已知重要的不良預後的prognostic標記，但是否為治療的predictive標記也未有定論。
至於bevacizumab(VEGF抗體)治療，目前仍沒有已知的有效生物標記。
總之，綜合使用TS、ERCC1、UGT1A1、dMMR、MSI-H、KRAS、BRAF等重要的生物標記，已使大腸癌的藥物治療正式進入「個人化醫療」的新時代。
化學治療藥物(5-Fluorouracil，簡稱5-FU、irinotecan、oxaliplatin等)?用新一代的標靶治療藥劑(cetuximab、bevacizumab等)已可有效延長晚期轉移性腸癌病人的中位數存活期。
隨著「個人化醫療」的進展，腸癌已有若干重要的「預後性」(prognostic)與「預測性」(predictive)生物標記(biomarker)可資運用，茲分述如下：一、Thymidylatesynthase(TS)，Excisionrepaircross-complementing1(ERCC1)，UGP-glucuronosyltransferase1A1(UGT1A1)與化學治療TS為5FU抑制嘧啶合成路徑之「標的酵素」，已知TS的表現降低與5FU治療反應率升高有顯著相關。
ERCC1是鉑類化合物(platinums)作用於細胞DNA的修復機制，細胞ERCC1的表現升高與oxalipatin為主的化療反應率降低有關。
TS與ERCC1均屬治療「反應」的predictive標記。
UGT1A1則是irinotecan的代謝酵素，UGT1A1＊28promoter的基因多形性(TA)7TAA同合子homozygousalleles引起UGT1A1活性降低，而使irinotecan的治療毒性大幅增加，屬於治療「毒性」的predictive標記。
二、微小衛星體不穩定性(microsatelliteinstability，MSI)與5FU輔助性化療核酸誤配修復(mismatchrepair，MMR)酵素MLH1、MSH2、PMS2、MSH3/6負責DNA之誤配修復，MMR酵素喪失(defectiveMMR，dMMR)時引起MSI不穩定性升高(MSI-high，MSI-H)，分別佔第二期與第三期腸癌之22%與12%。
這些MSI-H的腸癌病人預後較佳(prognostic)，但是接受5FU輔助性化療不但無益反而有害(predictive)，dMMR/MSI-H可作為prognostic與predictive標記。
三、KRAS、BRAF與EGFR單株抗體KRAS(codon12與13)突變型，造成KRAS下游訊息傳遞持續活化，是EGFR單株抗體(cetuximab、panitumumab)治療緩解率較低，無惡化存活期(PFS)較短的重要predictive標記，至於是否為prognostic標記仍莫衷一是。
BRAF(V600E)突變型是腸癌已知重要的不良預後的prognostic標記，但是否為治療的predictive標記也未有定論。
至於bevacizumab(VEGF抗體)治療，目前仍沒有已知的有效生物標記。
總之，綜合使用TS、ERCC1、UGT1A1、dMMR、MSI-H、KRAS、BRAF等重要的生物標記，已使大腸癌的藥物治療正式進入「個人化醫療」的新時代。
2. Microsatellite instability detection微星體不穩定檢測
微星體不穩定性(microsatellite instability，MSI)是指由於DNA在複製過程中，發生錯誤(replication eror，RER)後修改鹼基錯誤配對的MMR( ...Sidebar×認識我們簡介及特色組織介紹各組介紹生化組血液組門診鏡檢組細菌組血清免疫組血庫組分生檢驗暨病毒組緊急檢驗組品管組骨髓移植核心實驗室骨髓幹細胞中心免疫基因實驗室單位認證最新消息檢驗服務項目門診抽血服務時間生化檢驗血清檢驗特殊檢驗藥物檢驗血液鏡檢檢驗血庫檢驗門診檢驗細菌暨TB檢驗分生暨病毒檢驗骨髓移植核心實驗室檢驗免疫基因實驗室檢驗常見法定傳染病檢驗衛教專區教學與研究教學活動歷年研究發表網頁連結花蓮慈濟醫院衛生福利部中央健康保險署衛生福利部疾病管制署台灣醫事檢驗學會醫檢師公會全國聯合會繼續教育積分管理系統個人檢驗報告查詢轉檢檢驗報告查詢人員招募聯絡我們表單專區常用表單歷年公告歷年公告-108年度歷年公告-109年度認識我們簡介及特色組織介紹各組介紹生化組血液組門診鏡檢組細菌組血清免疫組血庫組分生檢驗暨病毒組緊急檢驗組品管組骨髓移植核心實驗室骨髓幹細胞中心免疫基因實驗室單位認證最新消息檢驗服務項目門診抽血服務時間生化檢驗血清檢驗特殊檢驗藥物檢驗血液鏡檢檢驗血庫檢驗門診檢驗細菌暨TB檢驗分生暨病毒檢驗骨髓移植核心實驗室檢驗免疫基因實驗室檢驗常見法定傳染病檢驗衛教專區教學與研究教學活動歷年研究發表網頁連結花蓮慈濟醫院衛生福利部中央健康保險署衛生福利部疾病管制署台灣醫事檢驗學會醫檢師公會全國聯合會繼續教育積分管理系統個人檢驗報告查詢轉檢檢驗報告查詢人員招募聯絡我們表單專區常用表單歷年公告歷年公告-108年度歷年公告-109年度最新訊息公告編號07：【委外檢驗項目】L0914-2021-02-01,週一04:01公告編號06：【生化檢驗組檢驗項目】新-2021-01-28,週四03:46公告編號05：新增檢驗科醫令代碼-2021-01-25,週一03:46公告編號04：【委外檢驗項目】L0916-2021-01-15,週五04:01公告編號03：【骨髓移殖核心實驗室檢驗項-2021-01-06,週三03:01詳細內容最近更新:2019-06-18 列印 Email 健保編號無醫令碼L11546檢體採集石蠟組織須附病理報告採集量 報告時效14日分析方法聚合酶連鎖反應定性檢驗ProFlexPCRSystem,ABI3130參考區間Microsatellitestability臨床意義微星體不穩定性(microsatelliteinstability，MSI)是指由於DNA在複製過程中，發生錯誤(replicationeror，RER)後修改鹼基錯誤配對的MMR(mismatchrepairgene)基因突變，導致其修復功能消失，所引起簡單重複序列的增加或減少，也稱為RER陽性或RER表型。
微星體不穩定性(microsatelliteinstability，MSI)是大腸癌發生的重要分子機制之一，約佔sporadic大腸直腸癌之15%，對大腸直腸癌具有重要臨床意義。
MSI也是遺傳性非息肉大腸直腸癌(HNPCC，林奇氏症Lynchsyndrome)的診斷標記。
又因MSI陽性的大腸直腸癌患者預後比起陰性者的表現較好，但對化學治療藥物(5-Fluorouracil)的效果較差，所以MSI也成為大腸直腸癌的預後和預測化療療效的標記。
注意事項此項目代檢單位為台北病理中心(資料來自台北病理中心) 搜尋...
微星體不穩定性(microsatelliteinstability，MSI)是大腸癌發生的重要分子機制之一，約佔sporadic大腸直腸癌之15%，對大腸直腸癌具有重要臨床意義。
MSI也是遺傳性非息肉大腸直腸癌(HNPCC，林奇氏症Lynchsyndrome)的診斷標記。
又因MSI陽性的大腸直腸癌患者預後比起陰性者的表現較好，但對化學治療藥物(5-Fluorouracil)的效果較差，所以MSI也成為大腸直腸癌的預後和預測化療療效的標記。
注意事項此項目代檢單位為台北病理中心(資料來自台北病理中心) 搜尋...
3. 臨床上如何檢測高度微衛星不穩定性(MSI)？
美國食品藥物管理局(US FDA) 核准pembrolizumab用於治療所有具有高度微衛星不穩定性(High Microsatellite Instability, MSI-H) 或DNA錯配修復 ...官方部落格首頁部落格2020-10-14臨床上如何檢測高度微衛星不穩定性(MSI)？BySGMSLTeamofACTGenomics美國食品藥物管理局(USFDA)核准pembrolizumab用於治療所有具有高度微衛星不穩定性(HighMicrosatelliteInstability,MSI-H)或DNA錯配修復缺陷(DNAMismatchRepairDeficiency,dMMR)且無法切除或轉移型的癌症(無論原發於何處)1，促成大腸直腸癌(ColorectalCancer,CRC)和子宮內膜癌(EndometrialCancer,EC)等非傳統MSI相關癌症進行MSI檢測的重要性。
市場上已經有次世代定序(Next-generationSequencing,NGS)為主的分子診斷檢測，並且採用NGS進行MSI評估的公司日益增加，但課題依然存在：相較於其他MSI檢測方法有何優勢？什麼是MSI？微衛星是DNA序列中的短重複序列，由大約重複5-50次的1-10個核苷酸所組成。
發生在個體基因體內的數千個位置，由於本質脆弱，其突變率是其他DNA區域的十倍。
MMR系統負責校正DNA複製過程中所產生的錯誤，當該系統發生功能異常時，通常是由於MMR基因(例如MLH1、MSH2、MSH6和PMS2)去活化性突變或表觀遺傳靜默，在微衛星區域累積錯誤。
因而會擴大或減少微衛星的長度，最終導致MSI。
現有的MSI檢測方法現可透過直接或間接的方式進行MSI檢測。
對於後者而言，免疫組織化學染色法 (Immunohistochemistry,IHC)用於確定上述MMR基因的表現。
如果蛋白質在正常細胞中表現，則假定腫瘤細胞中任何基因內蛋白質表現的喪失與dMMR相關。
現在直接檢測的標準方式為使用聚合酶連鎖反應(PolymeraseChainReaction,PCR)針對五個預先定義的微衛星標記進行MSI評估。
接受檢測的五個標記中，若有一個長度有所差異則被分類為低度微衛星不穩定性(MSI-Low,MSI-L)，如果至少兩個區域有所差異，則被稱為高度微衛星不穩定性(MSI-High,MSI-H)。
IHC和PCR的方法在評估MSI方面具有高度一致性2。
使用NGS資料進行MSI計算近期出現新的替代方案：使用NGS標靶檢測組直接評估MSI狀態，透過檢測基因中存在的MSI區域來辨識是否有不穩定性。
理想狀態下，可從腫瘤檢體和同個體正常檢體中的定序資料獲得微衛星長度。
當兩種檢體的長度分佈之間有顯著差異時，可以說該基因具有MSI不穩定性。
另一種方法則是透過腫瘤檢體與已建立的正常檢體資料庫進行比對，因此不需要與同個體的正常檢體進行比對34。
最後，與腫瘤突變負荷(TumorMutationalburden,TMB)的計算類似，檢測組大小也很重要，因為需要對足夠的微衛星區域進行定序才能準確評估MSI狀態。
NGS為主的MSI檢測與其他方法相比有何優勢？已經開發MANTIS、MOSAIC、mSINGS、MSIsensor等各種計算工具用於NGS資料進行MSI計算5，且每種方法均已與PCR為主的標準技術進行比較，確定具有高度一致性(靈敏度>94%和特異性>97%) 678910。
儘管PCR測定能夠直接檢測微衛星穩定(MicrosatelliteStable,MSS)、MSI-L和MSI-H族群，但大多數NGS為主的檢測僅報告MSS和MSI-H分類。
且目前免疫檢查點抑制劑僅核准用於MSI-H患者，而非MSI-L患者。
由於MSI模式可能因癌症類型而異，因此評估NGS為主的MSI檢測方法的準確性時，檢查是否對包括CRC和EC以外的各種腫瘤類型進行驗證是重要的考慮因素。
這將確保更全面、不偏向特定腫瘤類型的計算工具。
未來展望對於許多患者而言，受限於取得足夠的腫瘤組織。
而NGS為主的MSI檢測的最大好處在於，它能一次進行多項檢查，免除進行額外檢體切片的需求。
連同定序基因的完整突變圖譜以及TMB計算，標靶檢測組NGS檢測因此能夠從珍貴的標本中推斷出與療法相資訊。
此外，NGS為主的分析將有助於對所有癌症進行有效的MSI評估
市場上已經有次世代定序(Next-generationSequencing,NGS)為主的分子診斷檢測，並且採用NGS進行MSI評估的公司日益增加，但課題依然存在：相較於其他MSI檢測方法有何優勢？什麼是MSI？微衛星是DNA序列中的短重複序列，由大約重複5-50次的1-10個核苷酸所組成。
發生在個體基因體內的數千個位置，由於本質脆弱，其突變率是其他DNA區域的十倍。
MMR系統負責校正DNA複製過程中所產生的錯誤，當該系統發生功能異常時，通常是由於MMR基因(例如MLH1、MSH2、MSH6和PMS2)去活化性突變或表觀遺傳靜默，在微衛星區域累積錯誤。
因而會擴大或減少微衛星的長度，最終導致MSI。
現有的MSI檢測方法現可透過直接或間接的方式進行MSI檢測。
對於後者而言，免疫組織化學染色法 (Immunohistochemistry,IHC)用於確定上述MMR基因的表現。
如果蛋白質在正常細胞中表現，則假定腫瘤細胞中任何基因內蛋白質表現的喪失與dMMR相關。
現在直接檢測的標準方式為使用聚合酶連鎖反應(PolymeraseChainReaction,PCR)針對五個預先定義的微衛星標記進行MSI評估。
接受檢測的五個標記中，若有一個長度有所差異則被分類為低度微衛星不穩定性(MSI-Low,MSI-L)，如果至少兩個區域有所差異，則被稱為高度微衛星不穩定性(MSI-High,MSI-H)。
IHC和PCR的方法在評估MSI方面具有高度一致性2。
使用NGS資料進行MSI計算近期出現新的替代方案：使用NGS標靶檢測組直接評估MSI狀態，透過檢測基因中存在的MSI區域來辨識是否有不穩定性。
理想狀態下，可從腫瘤檢體和同個體正常檢體中的定序資料獲得微衛星長度。
當兩種檢體的長度分佈之間有顯著差異時，可以說該基因具有MSI不穩定性。
另一種方法則是透過腫瘤檢體與已建立的正常檢體資料庫進行比對，因此不需要與同個體的正常檢體進行比對34。
最後，與腫瘤突變負荷(TumorMutationalburden,TMB)的計算類似，檢測組大小也很重要，因為需要對足夠的微衛星區域進行定序才能準確評估MSI狀態。
NGS為主的MSI檢測與其他方法相比有何優勢？已經開發MANTIS、MOSAIC、mSINGS、MSIsensor等各種計算工具用於NGS資料進行MSI計算5，且每種方法均已與PCR為主的標準技術進行比較，確定具有高度一致性(靈敏度>94%和特異性>97%) 678910。
儘管PCR測定能夠直接檢測微衛星穩定(MicrosatelliteStable,MSS)、MSI-L和MSI-H族群，但大多數NGS為主的檢測僅報告MSS和MSI-H分類。
且目前免疫檢查點抑制劑僅核准用於MSI-H患者，而非MSI-L患者。
由於MSI模式可能因癌症類型而異，因此評估NGS為主的MSI檢測方法的準確性時，檢查是否對包括CRC和EC以外的各種腫瘤類型進行驗證是重要的考慮因素。
這將確保更全面、不偏向特定腫瘤類型的計算工具。
未來展望對於許多患者而言，受限於取得足夠的腫瘤組織。
而NGS為主的MSI檢測的最大好處在於，它能一次進行多項檢查，免除進行額外檢體切片的需求。
連同定序基因的完整突變圖譜以及TMB計算，標靶檢測組NGS檢測因此能夠從珍貴的標本中推斷出與療法相資訊。
此外，NGS為主的分析將有助於對所有癌症進行有效的MSI評估
4. Microsatellite instability @ 人生沒有用不到的經歷:: 痞客邦::
Microsatellite instability 是癌症研究的重要課題，它是很具體的DNA變化，但對於學生而言卻是十分抽象的概念。
Microsatellite 有點像是造物者 ...關閉廣告人生沒有用不到的經歷跳到主文國防醫學院二三事，歡迎學長、學弟妹、及國醫的朋友們光臨。
部落格全站分類：心情日記相簿部落格留言名片May23Mon201121:00MicrosatelliteinstabilityMicrosatelliteinstability是癌症研究的重要課題，它是很具體的DNA變化，但對於學生而言卻是十分抽象的概念。
Microsatellite有點像是造物者蓄意留下的核酸指印，主要序列是(CA)n，n=2-5(多半是3或4)。
這樣重覆的(CA)n散布於染色體各處，已知的Microsatellite有10萬多個，人與人之間有不同的Microsatellites。
當DNA的修補出現問題時，(CA)n會產生變化：有的是重覆的CA增加，有的是重覆的CA減少，有的是重覆的CA不見了，造成這些Microsatellite變化之原因來自DNAmismatchrepair(MMR)的缺陷。
Allelicloss實際上就是一種Lossofheterozygosity(LOH)。
英文解說在文底，有點複雜，只要知道是把錯誤的鹼基修正就好。
MMR的缺陷有些來自先天性的異常，有些來自後天諸多因素之影響，最常見的先天性缺陷是MMR的兩個重要蛋白質hMSH2與hMLH1發生突變以致失去功能。
B型與C型肝炎病毒感染的肝臟細胞，MMR會逐漸出現異常，造成某些Microsatellites發生變化(CA重覆增加、減少、或消失)，這種變化稱為Microsatelliteinstability(MSI)。
MSI可能為細胞癌化的早期徵兆，偵測肝細胞之MSI或許可以預測肝癌的發生，但要做肝臟穿刺取得肝細胞，因此診斷的價值不高。
但對於家族性肝癌的族群，偵測MSI的確可能是早期預測肝癌發生的有效方法。
此外，大腸息肉樣本取得容易，MSI檢測可預測大腸癌發生的機率。
DNAmismatchrepair (MMR)的英文解說：1.ThehMSH2/hMSH6heterodimerthatundergoesanATP-drivenconformationalchangeandrecruitsthehMLHl/hPMS2heterodimer.2.TheternarycomplexcantranslocateineitherdirectionalongtheDNAcontour(greenarrows).Whenitencountersastranddiscontinuity(suchasagapbetweenOkazakifragments)thatmaybeboundbyPCNA(bluecircle),loadingofanexonuclease(EXO1,red)initiatesdegradationofthenickedstrandtowardsthemismatch.3.Shouldtheexonucleasedissociatebeforeitreachesthemismatch,thesingle-strandedgapwillbestabilizedbyRPA(replicationproteinA,turquoisediamonds).LoadingofthesecondhMSH2/hMSH6/hMLHl/hPMS2complexatthemismatchwillstimulateasecondroundofexonucleolyticdegradation.4.Whenthisprocessisrepeatedathirdtime,themismatchisremoved.TheRPA-stabilisedsingle-strandedgapcannowbefilledinbythereplicativepolymeraseandtheremainingnickcanbesealedbyDNAligase.全站熱搜創作者介紹wleemc人生沒有用不到的經歷wleemc發表在痞客邦留言(2)人氣()E-mail轉寄全站分類：不設分類個人分類：醫學相關上一篇：我的美國夢-II下一篇：回覆置頂文章38樓留言▲top留言列表發表留言月曆«二月2021»日一二三四五六 12345678910111213141516171819202122232425
Microsatellite 有點像是造物者 ...關閉廣告人生沒有用不到的經歷跳到主文國防醫學院二三事，歡迎學長、學弟妹、及國醫的朋友們光臨。
部落格全站分類：心情日記相簿部落格留言名片May23Mon201121:00MicrosatelliteinstabilityMicrosatelliteinstability是癌症研究的重要課題，它是很具體的DNA變化，但對於學生而言卻是十分抽象的概念。
Microsatellite有點像是造物者蓄意留下的核酸指印，主要序列是(CA)n，n=2-5(多半是3或4)。
這樣重覆的(CA)n散布於染色體各處，已知的Microsatellite有10萬多個，人與人之間有不同的Microsatellites。
當DNA的修補出現問題時，(CA)n會產生變化：有的是重覆的CA增加，有的是重覆的CA減少，有的是重覆的CA不見了，造成這些Microsatellite變化之原因來自DNAmismatchrepair(MMR)的缺陷。
Allelicloss實際上就是一種Lossofheterozygosity(LOH)。
英文解說在文底，有點複雜，只要知道是把錯誤的鹼基修正就好。
MMR的缺陷有些來自先天性的異常，有些來自後天諸多因素之影響，最常見的先天性缺陷是MMR的兩個重要蛋白質hMSH2與hMLH1發生突變以致失去功能。
B型與C型肝炎病毒感染的肝臟細胞，MMR會逐漸出現異常，造成某些Microsatellites發生變化(CA重覆增加、減少、或消失)，這種變化稱為Microsatelliteinstability(MSI)。
MSI可能為細胞癌化的早期徵兆，偵測肝細胞之MSI或許可以預測肝癌的發生，但要做肝臟穿刺取得肝細胞，因此診斷的價值不高。
但對於家族性肝癌的族群，偵測MSI的確可能是早期預測肝癌發生的有效方法。
此外，大腸息肉樣本取得容易，MSI檢測可預測大腸癌發生的機率。
DNAmismatchrepair (MMR)的英文解說：1.ThehMSH2/hMSH6heterodimerthatundergoesanATP-drivenconformationalchangeandrecruitsthehMLHl/hPMS2heterodimer.2.TheternarycomplexcantranslocateineitherdirectionalongtheDNAcontour(greenarrows).Whenitencountersastranddiscontinuity(suchasagapbetweenOkazakifragments)thatmaybeboundbyPCNA(bluecircle),loadingofanexonuclease(EXO1,red)initiatesdegradationofthenickedstrandtowardsthemismatch.3.Shouldtheexonucleasedissociatebeforeitreachesthemismatch,thesingle-strandedgapwillbestabilizedbyRPA(replicationproteinA,turquoisediamonds).LoadingofthesecondhMSH2/hMSH6/hMLHl/hPMS2complexatthemismatchwillstimulateasecondroundofexonucleolyticdegradation.4.Whenthisprocessisrepeatedathirdtime,themismatchisremoved.TheRPA-stabilisedsingle-strandedgapcannowbefilledinbythereplicativepolymeraseandtheremainingnickcanbesealedbyDNAligase.全站熱搜創作者介紹wleemc人生沒有用不到的經歷wleemc發表在痞客邦留言(2)人氣()E-mail轉寄全站分類：不設分類個人分類：醫學相關上一篇：我的美國夢-II下一篇：回覆置頂文章38樓留言▲top留言列表發表留言月曆«二月2021»日一二三四五六 12345678910111213141516171819202122232425
5. 微衛星不穩定檢測套組
Microsatellite Instability Analysis Kit 微衛星不穩定檢測套組 說明 微衛星(microsatellites)是遍佈於人類基因組中的短串聯重複序列。
與正常組織相比，腫瘤組織的微 ...微衛星不穩定檢測(MSI)首頁產品資訊微衛星不穩定檢測(MSI)產品資訊Real-TimePCR(qPCR)SYBRGreen螢光染料法Real-TimePCR耗材TaqMan螢光探針法TaqManAssayTaqMan專用預混液COVID-19核酸檢測試劑PCREnzymes&MasterMixesHigh-Fidelity&Long-RangePCREnzymesConventionalPCREnzymesHighProductionPCREnzymesMultiplexPCREnzymesDirectPCRNucleicAcidStainDNAMarker/Ladder高通量定序文庫構建DNANGS建庫製備試劑盒RNANGS建庫製備試劑盒SingleCellNGS建庫製備試劑盒反轉錄試劑一般定序&片段分析試劑核酸純化試劑基因組DNA純化RNA純化系列質體(Plasmid)DNA純化膠體DNA回收純化石蠟包埋(FFPE)DNA純化血清/血漿游離cfDNA純化糞便DNA純化細菌DNA萃取磁力座/磁力架外泌體純化試劑克隆&突變核酸穩定試劑探針&引子&寡核苷酸合成RNA合成客製化RNA標準品RNAi(小分子RNA合成干擾)小分子RNA合成In-Vitro(細胞實驗)小分子RNA合成In-Vivo(動物實驗)miRNA/microRNA研究策略Cell-FreeDNA,cfDNA黴漿菌qPCR檢測微衛星不穩定檢測(MSI)儀器設備基因編輯細胞實驗分析鴿子性別檢測服務微衛星不穩定檢測套組(MSI) PNNameSizePrice(TWD)MSI-DNA-100MicrosatelliteInstabilityAnalysisKit100rxn39,375SVMSI001MicrosatelliteInstabilityDetectionService1/Sample4,000MicrosatelliteInstabilityAnalysisKit微衛星不穩定檢測套組 說明 微衛星(microsatellites)是遍佈於人類基因組中的短串聯重複序列。
與正常組織相比，腫瘤組織的微衛星由於複製錯誤(replicationerror,RER)引起的簡單重複序列的增加或丟失而導致微衛星長度的改變，就叫做微衛星不穩定性(MicrosatelliteInstability，MSI)。
在正常組織中，DNA複製錯誤可被錯配修復機制校正；在腫瘤組織中，錯配修復(MMR)基因發生突變，無法修復複製錯誤以致MSI產生，故MSI與腫瘤的發生密切相關。
目前MSI作為腫瘤遺傳不穩定一個敏感的檢測指標已逐漸被大家接受，並且臨床上已將MSI作為結直腸癌預後和制定輔助治療方案的重要分子標誌物。
由於MSI的存在，正常組織與腫瘤組織的微衛星在長度上形成差異，可以利用毛細管電泳鑒定。
結直腸癌（ColorectalCancer,CRC）發生的遺傳因素包括染色體不穩定性（ChromosomeInstability,CIN）和微衛星不穩定性（MicrosatelliteInstability,MSI）。
其中大約15-20%的CRC則主要是由MSI引起，包括遺傳性非息肉病性結直腸癌（HereditaryNonpolyposisColorectalCancer,HNPCC，又稱Lynch綜合徵）（錯配修復基因胚系突變）和散發性MSI（+）CRC（錯配修復基因MLH1基因啟動子甲基化）。
原理 利用微衛星位點基因分型進行MSI檢測，針對微衛星位點設計螢光引物，螢光PCR引物對多個微衛星多態位點進行擴增，然後通過毛細管電泳對多態性擴增片段進行分離，通過螢光檢測系統（如ABI測序儀）確定擴增片斷的長度，實現對微衛星多態位點的分型。
與正常組織相比較，若腫瘤組織微衛星等位基因條帶增多和大小發生改變則記為微衛星不穩定。
這是由於DNA複製期間修復錯配的基因超家族產生了突變，導致容易發生鏈滑，簡單重複DNA核苷酸在複製過程中產生了細小序列改變。
使用螢光PCR引物的方法來檢測MSI非常方便和快捷，結果也能直觀準確的檢測到。
報告範例 檢體提供 -異常組織/DNA-正常組織/周邊血/DNA說明下載檔案下載回上層
與正常組織相比，腫瘤組織的微 ...微衛星不穩定檢測(MSI)首頁產品資訊微衛星不穩定檢測(MSI)產品資訊Real-TimePCR(qPCR)SYBRGreen螢光染料法Real-TimePCR耗材TaqMan螢光探針法TaqManAssayTaqMan專用預混液COVID-19核酸檢測試劑PCREnzymes&MasterMixesHigh-Fidelity&Long-RangePCREnzymesConventionalPCREnzymesHighProductionPCREnzymesMultiplexPCREnzymesDirectPCRNucleicAcidStainDNAMarker/Ladder高通量定序文庫構建DNANGS建庫製備試劑盒RNANGS建庫製備試劑盒SingleCellNGS建庫製備試劑盒反轉錄試劑一般定序&片段分析試劑核酸純化試劑基因組DNA純化RNA純化系列質體(Plasmid)DNA純化膠體DNA回收純化石蠟包埋(FFPE)DNA純化血清/血漿游離cfDNA純化糞便DNA純化細菌DNA萃取磁力座/磁力架外泌體純化試劑克隆&突變核酸穩定試劑探針&引子&寡核苷酸合成RNA合成客製化RNA標準品RNAi(小分子RNA合成干擾)小分子RNA合成In-Vitro(細胞實驗)小分子RNA合成In-Vivo(動物實驗)miRNA/microRNA研究策略Cell-FreeDNA,cfDNA黴漿菌qPCR檢測微衛星不穩定檢測(MSI)儀器設備基因編輯細胞實驗分析鴿子性別檢測服務微衛星不穩定檢測套組(MSI) PNNameSizePrice(TWD)MSI-DNA-100MicrosatelliteInstabilityAnalysisKit100rxn39,375SVMSI001MicrosatelliteInstabilityDetectionService1/Sample4,000MicrosatelliteInstabilityAnalysisKit微衛星不穩定檢測套組 說明 微衛星(microsatellites)是遍佈於人類基因組中的短串聯重複序列。
與正常組織相比，腫瘤組織的微衛星由於複製錯誤(replicationerror,RER)引起的簡單重複序列的增加或丟失而導致微衛星長度的改變，就叫做微衛星不穩定性(MicrosatelliteInstability，MSI)。
在正常組織中，DNA複製錯誤可被錯配修復機制校正；在腫瘤組織中，錯配修復(MMR)基因發生突變，無法修復複製錯誤以致MSI產生，故MSI與腫瘤的發生密切相關。
目前MSI作為腫瘤遺傳不穩定一個敏感的檢測指標已逐漸被大家接受，並且臨床上已將MSI作為結直腸癌預後和制定輔助治療方案的重要分子標誌物。
由於MSI的存在，正常組織與腫瘤組織的微衛星在長度上形成差異，可以利用毛細管電泳鑒定。
結直腸癌（ColorectalCancer,CRC）發生的遺傳因素包括染色體不穩定性（ChromosomeInstability,CIN）和微衛星不穩定性（MicrosatelliteInstability,MSI）。
其中大約15-20%的CRC則主要是由MSI引起，包括遺傳性非息肉病性結直腸癌（HereditaryNonpolyposisColorectalCancer,HNPCC，又稱Lynch綜合徵）（錯配修復基因胚系突變）和散發性MSI（+）CRC（錯配修復基因MLH1基因啟動子甲基化）。
原理 利用微衛星位點基因分型進行MSI檢測，針對微衛星位點設計螢光引物，螢光PCR引物對多個微衛星多態位點進行擴增，然後通過毛細管電泳對多態性擴增片段進行分離，通過螢光檢測系統（如ABI測序儀）確定擴增片斷的長度，實現對微衛星多態位點的分型。
與正常組織相比較，若腫瘤組織微衛星等位基因條帶增多和大小發生改變則記為微衛星不穩定。
這是由於DNA複製期間修復錯配的基因超家族產生了突變，導致容易發生鏈滑，簡單重複DNA核苷酸在複製過程中產生了細小序列改變。
使用螢光PCR引物的方法來檢測MSI非常方便和快捷，結果也能直觀準確的檢測到。
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6. 高度微衛星不穩定性（MSI）腫瘤免疫治療反應佳
微衛星不穩定性（microsatellite instability，MSI）是指由於在DNA 複製時插入或Read More.繁體简体NavigateYouareat:Home»科技新知»高度微衛星不穩定性（MSI）腫瘤免疫治療反應佳微衛星不穩定性（microsatelliteinstability，MSI）是指由於在DNA複製時插入或缺失突變引起的微衛星序列長度改變的現象，常由錯配修復功能缺陷（mismatchrepairdeficiency,MMR-d）引起。
許多臨床研究證實，MSI與結腸癌、胃癌、子宮內膜癌、卵巢癌、肝膽管癌、泌尿道癌、腦癌和皮膚癌等癌症進展有關。
近日，由JohnsHopkinsKimmel癌症中心、Bloomberg-Kimmel癌症免疫治療研究所和SloanKettering紀念癌症中心所組成的研究團隊發現，MSI表現高的腫瘤有較佳的PD-1免疫療法反應，優於MSI表現低的腫瘤。
該研究發表於《Science》。
首先，該研究團隊使用CRISPR-Cas9來基因編輯小鼠黑色素瘤和小鼠結腸直腸癌細胞系，並且製造具有MMR-d的腫瘤，類似於人類腫瘤細胞，並在數週內生長。
他們將生長4星期的腫瘤稱為MSI-M（MSI-intermediate）細胞株，而那些生長4個月的腫瘤稱為MSI-H（MSI-high）細胞株。
接著，他們透過全外顯子體定序分析發現，與為實驗創建的MSI-M細胞株或原始母細胞株相比，MSI-H有更多的DNA插入缺失（insertion/deletion,InDel）突變和誤義（missense）突變（在細胞分裂期間僅替換一個遺傳字母）。
然後他們將上述細胞株植入活小鼠的側腹，使用抗PD-1檢查點抑製劑或假治療對小鼠進行治療。
結果顯示，與植入MSI-M和原始母細胞株的腫瘤相比，植入MSI-H細胞株比的腫瘤顯著降低。
在植入24天後，他們再進一步分析小鼠腫瘤中腫瘤浸潤淋巴細胞（攻擊和破壞腫瘤細胞的免疫系統白血球）的數量。
與其他樣本相比，抗PD-1治療後MSI-H腫瘤中的腫瘤浸潤淋巴細胞顯著增加，顯示該反應與免疫系統有關。
隨後，他們再對MSI-H細胞株腫瘤的DNA進行定序，發現用抗PD-1治療的錯義和InDel突變減少。
因此，由上述結果證實，該突變是產生免疫系統識別和消除的新抗原的原因。
在該研究結果的基礎上，他們也研究三個獨立的癌症患者隊列的臨床數據，分析MSI強度與人體抗PD-1治療反應之間的關係。
他們首先檢測免疫活性季線，即透過以前報導的標準化免疫活動評分（CYT）測量的，測量14種人類癌症。
然後發現，與MSI-L（MSI-low）腫瘤相比，在MSI-H腫瘤中的免疫活性有增加的趨勢。
他們還分析二組具有錯配修復缺陷且接受抗PD-1免疫治療的腫瘤患者DNA序列。
在第一組研究中，與較低遺傳MSI表現的患者相比，具有較高遺傳MSI表現的患者通常對免疫治療具有完全或非常好反應。
在第二組研究中，使用免疫檢查點抑製劑治療後，前80％MSI表現佳的患者與生存率改善有顯著的相關性。
該研究團隊下一步將探討先天免疫系統在MSI相關免疫反應中的作用，並確認基線或連續產生的突變，特別是InDel突變為免疫治療反應的原因。
延伸閱讀：免疫治療前的關鍵診斷次世代定序檢測微衛星體不穩定性參考資料：1.Science,2019;364(6439):485DOI:10.1126/science.aau04472.https://www.hopkinsmedicine.org/news/newsroom/news-releases/tumor-mutations-may-predict-response-to-immunotherapy©www.geneonline.news.Allrightsreserved.基因線上版權所有未經授權不得轉載。
合作請聯繫：[email protected]分享此文：按一下以分享至Facebook(在新視窗中開啟)分享到Twitter(在新視窗中開啟)分享到LinkedIn(在新視窗中開啟)點這裡寄給朋友(在新視窗中開啟)點這裡列印(在新視窗中開啟)分享到WhatsApp(在新視窗中開啟)按一下即可分享至Skype(在新視窗中開啟)RelatedPosts2021年2月5日0阿茲海默症風險基因ApoE4表現高，容易被SARS-CoV-2感染？2021年2月3
許多臨床研究證實，MSI與結腸癌、胃癌、子宮內膜癌、卵巢癌、肝膽管癌、泌尿道癌、腦癌和皮膚癌等癌症進展有關。
近日，由JohnsHopkinsKimmel癌症中心、Bloomberg-Kimmel癌症免疫治療研究所和SloanKettering紀念癌症中心所組成的研究團隊發現，MSI表現高的腫瘤有較佳的PD-1免疫療法反應，優於MSI表現低的腫瘤。
該研究發表於《Science》。
首先，該研究團隊使用CRISPR-Cas9來基因編輯小鼠黑色素瘤和小鼠結腸直腸癌細胞系，並且製造具有MMR-d的腫瘤，類似於人類腫瘤細胞，並在數週內生長。
他們將生長4星期的腫瘤稱為MSI-M（MSI-intermediate）細胞株，而那些生長4個月的腫瘤稱為MSI-H（MSI-high）細胞株。
接著，他們透過全外顯子體定序分析發現，與為實驗創建的MSI-M細胞株或原始母細胞株相比，MSI-H有更多的DNA插入缺失（insertion/deletion,InDel）突變和誤義（missense）突變（在細胞分裂期間僅替換一個遺傳字母）。
然後他們將上述細胞株植入活小鼠的側腹，使用抗PD-1檢查點抑製劑或假治療對小鼠進行治療。
結果顯示，與植入MSI-M和原始母細胞株的腫瘤相比，植入MSI-H細胞株比的腫瘤顯著降低。
在植入24天後，他們再進一步分析小鼠腫瘤中腫瘤浸潤淋巴細胞（攻擊和破壞腫瘤細胞的免疫系統白血球）的數量。
與其他樣本相比，抗PD-1治療後MSI-H腫瘤中的腫瘤浸潤淋巴細胞顯著增加，顯示該反應與免疫系統有關。
隨後，他們再對MSI-H細胞株腫瘤的DNA進行定序，發現用抗PD-1治療的錯義和InDel突變減少。
因此，由上述結果證實，該突變是產生免疫系統識別和消除的新抗原的原因。
在該研究結果的基礎上，他們也研究三個獨立的癌症患者隊列的臨床數據，分析MSI強度與人體抗PD-1治療反應之間的關係。
他們首先檢測免疫活性季線，即透過以前報導的標準化免疫活動評分（CYT）測量的，測量14種人類癌症。
然後發現，與MSI-L（MSI-low）腫瘤相比，在MSI-H腫瘤中的免疫活性有增加的趨勢。
他們還分析二組具有錯配修復缺陷且接受抗PD-1免疫治療的腫瘤患者DNA序列。
在第一組研究中，與較低遺傳MSI表現的患者相比，具有較高遺傳MSI表現的患者通常對免疫治療具有完全或非常好反應。
在第二組研究中，使用免疫檢查點抑製劑治療後，前80％MSI表現佳的患者與生存率改善有顯著的相關性。
該研究團隊下一步將探討先天免疫系統在MSI相關免疫反應中的作用，並確認基線或連續產生的突變，特別是InDel突變為免疫治療反應的原因。
延伸閱讀：免疫治療前的關鍵診斷次世代定序檢測微衛星體不穩定性參考資料：1.Science,2019;364(6439):485DOI:10.1126/science.aau04472.https://www.hopkinsmedicine.org/news/newsroom/news-releases/tumor-mutations-may-predict-response-to-immunotherapy©www.geneonline.news.Allrightsreserved.基因線上版權所有未經授權不得轉載。
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7. 微衛星(microsatellites) -光鼎生物科技股份有限公司
... 腫瘤組織中，錯配修復的基因發生突變，導致微衛星複製錯誤無法被校正，造成簡單重複序列長度的改變，稱作微衛星不穩定性(Microsatellite Instability，MSI)。
產品應用首頁產品應用列表DNACRISPR(ClustersofRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats)cfDNA(CirculatingCellFreeDNA)染色質免疫沉澱(ChromatinImmunoprecipitation,ChIP)基因組 DNA (GenomicDNA-gDNA) 微衛星(microsatellites)次世代定序 (NextGenerationSequencing,NGS) OligoNucleotide質體 (Plasmid)RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)SNP(Single-nucleotidepolymorphism)GenotypingRNARNASampleQC創新型mRNA疫苗研發管控新選擇蛋白質FluorescenceDetectionofProtein醣類Glycan免疫分析ImmunoAssay疾病檢測MolecularDiagnostic(MDx)PlatformforOn-SiteTestingofInfectiousDiseases:SARS-CoV-2微衛星(microsatellites) 微衛星也稱為簡單序列重複序列（SimpleSequenceRepeats，SSRs）或短串聯重複序列（shorttandemrepeats，STRs），是一種不同數目逢機重複序列（VNTR），其重複序列通常介於1~6bp，植物細胞核基因組中最常以2bp為重複單位。
微衛星遍布於染色體中，與基因相似，然而，它們是在DNA編碼中重複多次（3-100次）的短串核苷酸。
例如，CACACACA。
這些標誌物通常呈現高度的種間和種內多型性，特別是當重複數為10或更多時。
重複的數量可以在同一物種的不同等位基因上變化。
如果一個人的微衛星突變不影響其生存能力，那麼所述突變可能會留在人群中，因為它會通過後代傳遞下去。
因此，你可能會得到在世代人群中大量存在的微衛星突變等位基因。
微衛星可用於基因分析，因為它們可以用來識別個人。
這在刑事案件，人口遺傳學研究等方面非常有用。
應用 微衛星通常是共顯性的。
它們被用作遺傳學，親緣關係，人口和其他研究的分子標記。
它們也可用於研究基因複製或缺失，分子標記輔助育種和指紋識別。
除了刑事案件中查緝毒品，可利用STR基因分析大麻外，高經濟性作物（如蘭花）也可以利用STR基因研判品種。
突變的腫瘤組織中，錯配修復的基因發生突變，導致微衛星複製錯誤無法被校正，造成簡單重複序列長度的改變，稱作微衛星不穩定性(MicrosatelliteInstability，MSI)。
這種正常組織與腫瘤組織在微衛星長度上的差異，可以針對微衛星位點設計螢光引物進行PCR擴增，再利用毛細管電泳進行片段大小分析。
傳統方法採用聚丙烯酰胺凝膠電泳進行分析，但耗時且操作不便，因此在大規模、多批次的數據收集和分析時，同時需具有高分辨率，自動化的Qsep100CGEDNA片段分析儀就是一個快速準確、高效率的檢測方法。
產品應用首頁產品應用列表DNACRISPR(ClustersofRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats)cfDNA(CirculatingCellFreeDNA)染色質免疫沉澱(ChromatinImmunoprecipitation,ChIP)基因組 DNA (GenomicDNA-gDNA) 微衛星(microsatellites)次世代定序 (NextGenerationSequencing,NGS) OligoNucleotide質體 (Plasmid)RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)SNP(Single-nucleotidepolymorphism)GenotypingRNARNASampleQC創新型mRNA疫苗研發管控新選擇蛋白質FluorescenceDetectionofProtein醣類Glycan免疫分析ImmunoAssay疾病檢測MolecularDiagnostic(MDx)PlatformforOn-SiteTestingofInfectiousDiseases:SARS-CoV-2微衛星(microsatellites) 微衛星也稱為簡單序列重複序列（SimpleSequenceRepeats，SSRs）或短串聯重複序列（shorttandemrepeats，STRs），是一種不同數目逢機重複序列（VNTR），其重複序列通常介於1~6bp，植物細胞核基因組中最常以2bp為重複單位。
微衛星遍布於染色體中，與基因相似，然而，它們是在DNA編碼中重複多次（3-100次）的短串核苷酸。
例如，CACACACA。
這些標誌物通常呈現高度的種間和種內多型性，特別是當重複數為10或更多時。
重複的數量可以在同一物種的不同等位基因上變化。
如果一個人的微衛星突變不影響其生存能力，那麼所述突變可能會留在人群中，因為它會通過後代傳遞下去。
因此，你可能會得到在世代人群中大量存在的微衛星突變等位基因。
微衛星可用於基因分析，因為它們可以用來識別個人。
這在刑事案件，人口遺傳學研究等方面非常有用。
應用 微衛星通常是共顯性的。
它們被用作遺傳學，親緣關係，人口和其他研究的分子標記。
它們也可用於研究基因複製或缺失，分子標記輔助育種和指紋識別。
除了刑事案件中查緝毒品，可利用STR基因分析大麻外，高經濟性作物（如蘭花）也可以利用STR基因研判品種。
突變的腫瘤組織中，錯配修復的基因發生突變，導致微衛星複製錯誤無法被校正，造成簡單重複序列長度的改變，稱作微衛星不穩定性(MicrosatelliteInstability，MSI)。
這種正常組織與腫瘤組織在微衛星長度上的差異，可以針對微衛星位點設計螢光引物進行PCR擴增，再利用毛細管電泳進行片段大小分析。
傳統方法採用聚丙烯酰胺凝膠電泳進行分析，但耗時且操作不便，因此在大規模、多批次的數據收集和分析時，同時需具有高分辨率，自動化的Qsep100CGEDNA片段分析儀就是一個快速準確、高效率的檢測方法。